Из-за сильных перепадов высот, погода отличается в разных частях страны. Климат в целом мягкий, на юге более влажный, тропический, со средней температурой воздуха +28°C. На плоскогорье прохладнее, в среднем +20°C. Самые жаркие месяцы — с февраля по май. С мая по октябрь возможны наводнения и ураганы из-за тропических ливней. В декабре — январе по ночам температура может опускаться до −10°C в горах и до 0 °C на плоскогорье.

Лучшее время для посещения Гватемалы — с ноября по май.