Гондурас расположен в Центральной Америке и граничит на западе с Гватемалой, на юго-западе - с Сальвадором, на юго-востоке - с Никарагуа. Также к территории Гондураса относятся острова Ислас-де-ла-Баия (Роатан, Утила, Гуанаха и др.), находящиеся в Карибском море, и отрезок тихоокеанского побережья длиной в 25 км, а также некоторые острова, расположенные вдоль него. 80% территории Гондураса - гористые районы с бесчисленными долинами различной величины.

Самые высокие горы располагаются на западе Гондураса; это Пико-Конголин (2500 м) и Серро-де-лас-Минас (2850 м), склоны которых покрыты густыми сосновыми лесами. В гористой части Гондураса наиболее удобным транспортным путем является лощина, пересекающая страну от карибского побережья до залива Голфо-де-Фонсека в Тихом океане. На северном побережье Гондураса находятся низменности, плодородные земли которых используются для выращивания кофе, сахарного тростника, ананасов и т.д.